Dentro de la estación Mixcoac de la Línea 12 se encuentra el Museo del Metro, un espacio que reúne más de cinco décadas de historia del Sistema de Transporte Colectivo. Desde su apertura en enero de 2017, el recinto ha recibido a 278 mil 371 visitantes y conserva planos originales, fotografías, objetos utilizados en los primeros años de operación y piezas arqueológicas encontradas durante la construcción de distintas líneas.
El museo cuenta con siete salas permanentes y un acervo de 3 mil 979 piezas, entre boletos, tarjetas, uniformes, mobiliario y equipos. Entre los objetos destacan uno de los primeros asientos de los trenes, un reloj utilizado en los andenes, una lámpara ferroviaria y el uniforme de los primeros conductores. También se exhiben planos de las líneas 1 y 2, imágenes de la construcción del sistema y una muestra del convoy MP-68, el primer modelo de rodadura neumática utilizado por el Metro.
La colección incluye además objetos arqueológicos recuperados durante las obras, como una flauta de la época mexica hallada durante la construcción de la Línea 8, así como bocetos del logotipo del Metro. El recinto también presenta exposiciones temporales y actividades artísticas. La entrada es gratuita y puede visitarse de martes a viernes, de 10:00 a 18:00 horas, y sábados y domingos, de 11:00 a 14:00 horas.